人源脱嘌呤/脱嘧啶 (AP) 核酸内切酶 APE 1，也称为HAP 1或Ref-1，作为一种AP裂解酶，可水解断裂脱嘌呤/脱嘧啶位点 5' 端的磷酸二酯键，产生单链 DNA 断裂，留下3' 羟基和 5' 脱氧核糖磷酸末端。
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也称作T4 PDG (T4 嘧啶二聚体糖基化酶) ，既有 DNA 糖基化酶活性，又有 AP 裂解酶活性。该酶可识别因紫外线照射引起的 cis-syn 型环丁烷嘧啶二聚体。该酶可结合在双链DNA的嘧啶二聚体，可在嘧啶二聚体的5’端切割糖苷键，同时其内切酶活性切割AP位点上的磷酸二酯键。
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T4核酸内切酶VII是一种DNA连接特异性核酸内切酶（也称作解离酶或水解酶）。T4核酸内切酶 VII可在体内降解新合成DNA的分支DNA结构，也可识别错误的碱基配对，碱基插入，切除loops、gaps、脱嘌呤/脱嘧啶位点，在DNA链对应位点形成切口。
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核酸内切酶IV（E.coli）是一种II类脱嘌呤/脱嘧啶酶，能通过水解作用切断5’端和AP位点之间的连接，形成3’羟基和5’端脱氧核糖-5’-磷酸盐。Endo IV可用于体内DNA游离基的修复。
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